Le Secrétariat du FSN, dirigé par le Secrétaire exécutif, exécute l'ensemble des tâches courantes et les activités opérationnelles relatives au mandat du FSN. Il appuie directement les activités du Conseil de Fondation, du Comité exécutif et du Comité scientifique en fournissant toutes les prestations organisationnelles, logistiques et techniques requises.

Le Secrétariat se compose notamment de:

un Secrétaire exécutif, M. Alain Clerc

une Directrice de projets, Mme Elena Ursache

un Directeur informatique, M. Mehdy Davary

un Consultant informatique, M. Alberto Feldkircher

un Directeur de projets, M. Cissé Kane

une Chargée du secrétariat, Mme Hélène Herdt

une Assistante de projets, Mme Tania Zinoviev